Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtpraP18052 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtpraP18052 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtpraP18052 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtpraP18052 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtpraP18052 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtpraP18052 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PtpraP18052 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtpraP18052 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtpraP18052 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PtpraP18052 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtpraP18052 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtpraP18052 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PtpraP18052 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtpraP18052 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PtpraP18052 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtpraP18052 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtpraP18052 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtpraP18052 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtpraP18052 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtpraP18052 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtpraP18052 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtpraP18052 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtpraP18052 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PtpraP18052 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtpraP18052 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtpraP18052 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtpraP18052 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtpraP18052 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtpraP18052 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtpraP18052 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtpraP18052 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtpraP18052 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtpraP18052 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtpraP18052 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PtpraP18052 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PtpraP18052 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtpraP18052 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PtpraP18052 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtpraP18052 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtpraP18052 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtpraP18052 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtpraP18052 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtpraP18052 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtpraP18052 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtpraP18052 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtpraP18052 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtpraP18052 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtpraP18052 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtpraP18052 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtpraP18052 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PtpraP18052 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtpraP18052 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtpraP18052 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtpraP18052 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtpraP18052 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtpraP18052 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtpraP18052 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtpraP18052 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtpraP18052 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtpraP18052 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtpraP18052 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtpraP18052 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtpraP18052 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtpraP18052 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtpraP18052 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtpraP18052 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtpraP18052 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtpraP18052 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtpraP18052 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtpraP18052 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtpraP18052 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtpraP18052 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtpraP18052 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtpraP18052 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtpraP18052 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtpraP18052 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtpraP18052 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtpraP18052 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtpraP18052 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtpraP18052 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtpraP18052 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtpraP18052 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtpraP18052 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtpraP18052 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtpraP18052 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtpraP18052 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtpraP18052 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtpraP18052 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtpraP18052 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtpraP18052 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtpraP18052 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtpraP18052 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtpraP18052 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtpraP18052 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtpraP18052 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtpraP18052 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtpraP18052 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtpraP18052 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtpraP18052 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
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