Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Nme1P15532 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme1P15532 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme1P15532 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme1P15532 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme1P15532 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme1P15532 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme1P15532 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme1P15532 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme1P15532 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme1P15532 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme1P15532 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nme1P15532 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nme1P15532 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nme1P15532 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nme1P15532 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nme1P15532 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nme1P15532 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nme1P15532 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nme1P15532 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nme1P15532 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nme1P15532 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nme1P15532 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nme1P15532 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nme1P15532 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nme1P15532 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.4 ms