Protein–RNA interactions for Protein: P11378

Tnp2, Nuclear transition protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp2P11378 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnp2P11378 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnp2P11378 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnp2P11378 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnp2P11378 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tnp2P11378 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnp2P11378 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnp2P11378 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnp2P11378 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnp2P11378 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnp2P11378 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnp2P11378 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnp2P11378 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnp2P11378 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnp2P11378 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnp2P11378 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnp2P11378 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnp2P11378 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tnp2P11378 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnp2P11378 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnp2P11378 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnp2P11378 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnp2P11378 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnp2P11378 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnp2P11378 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnp2P11378 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnp2P11378 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnp2P11378 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnp2P11378 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tnp2P11378 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Tnp2P11378 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tnp2P11378 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tnp2P11378 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnp2P11378 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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