Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FlgP11088 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FlgP11088 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FlgP11088 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FlgP11088 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FlgP11088 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FlgP11088 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FlgP11088 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FlgP11088 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FlgP11088 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FlgP11088 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FlgP11088 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FlgP11088 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FlgP11088 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FlgP11088 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FlgP11088 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FlgP11088 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FlgP11088 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FlgP11088 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FlgP11088 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FlgP11088 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FlgP11088 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FlgP11088 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FlgP11088 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FlgP11088 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FlgP11088 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FlgP11088 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FlgP11088 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FlgP11088 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FlgP11088 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FlgP11088 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FlgP11088 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FlgP11088 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FlgP11088 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FlgP11088 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FlgP11088 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FlgP11088 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FlgP11088 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FlgP11088 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FlgP11088 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FlgP11088 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FlgP11088 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FlgP11088 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FlgP11088 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FlgP11088 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FlgP11088 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FlgP11088 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FlgP11088 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FlgP11088 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FlgP11088 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FlgP11088 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FlgP11088 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FlgP11088 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FlgP11088 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FlgP11088 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FlgP11088 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FlgP11088 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FlgP11088 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FlgP11088 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FlgP11088 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FlgP11088 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FlgP11088 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FlgP11088 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FlgP11088 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FlgP11088 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FlgP11088 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FlgP11088 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FlgP11088 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FlgP11088 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FlgP11088 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FlgP11088 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FlgP11088 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FlgP11088 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FlgP11088 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FlgP11088 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FlgP11088 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FlgP11088 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FlgP11088 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FlgP11088 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FlgP11088 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FlgP11088 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FlgP11088 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FlgP11088 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FlgP11088 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FlgP11088 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FlgP11088 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FlgP11088 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FlgP11088 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FlgP11088 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FlgP11088 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FlgP11088 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FlgP11088 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FlgP11088 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FlgP11088 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FlgP11088 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FlgP11088 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FlgP11088 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FlgP11088 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FlgP11088 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FlgP11088 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms