Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Amd1P0DMN7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Amd1P0DMN7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms