Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Becn2P0DM65 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Becn2P0DM65 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Becn2P0DM65 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms