Protein–RNA interactions for Protein: P09632

Hoxb8, Homeobox protein Hox-B8, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb8P09632 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxb8P09632 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb8P09632 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms