Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
P01678 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
P01678 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01678 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01678 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01678 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01678 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01678 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01678 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01678 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01678 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01678 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01678 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01678 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
P01678 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01678 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01678 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01678 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01678 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01678 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01678 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01678 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01678 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01678 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01678 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01678 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01678 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01678 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01678 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01678 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01678 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01678 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01678 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01678 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01678 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01678 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01678 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01678 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01678 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01678 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01678 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01678 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01678 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01678 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01678 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01678 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01678 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01678 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01678 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01678 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01678 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01678 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01678 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01678 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01678 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01678 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01678 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01678 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01678 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
P01678 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01678 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01678 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01678 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01678 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01678 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01678 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01678 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01678 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01678 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01678 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01678 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01678 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
P01678 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01678 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
P01678 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01678 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01678 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01678 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01678 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01678 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01678 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01678 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01678 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
P01678 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01678 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01678 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01678 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
P01678 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
P01678 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01678 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01678 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01678 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01678 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01678 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
P01678 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
P01678 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01678 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01678 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01678 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01678 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms