Protein–RNA interactions for Protein: P01647

Ig kappa chain V-V region HP 124E1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01647 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01647 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01647 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
P01647 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
P01647 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
P01647 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01647 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P01647 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01647 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01647 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01647 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01647 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01647 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01647 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01647 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01647 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01647 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01647 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01647 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01647 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01647 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01647 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01647 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
P01647 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01647 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01647 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
P01647 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01647 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01647 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
P01647 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01647 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01647 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01647 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01647 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01647 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01647 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01647 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01647 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01647 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01647 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01647 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01647 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01647 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01647 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01647 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01647 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01647 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01647 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01647 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01647 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01647 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01647 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01647 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01647 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
P01647 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01647 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01647 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01647 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
P01647 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01647 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01647 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01647 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01647 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01647 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01647 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01647 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01647 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01647 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01647 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01647 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01647 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01647 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P01647 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01647 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01647 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01647 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01647 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01647 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P01647 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01647 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01647 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
P01647 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01647 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01647 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01647 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01647 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01647 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P01647 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01647 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01647 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01647 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01647 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01647 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
P01647 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
P01647 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01647 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01647 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01647 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01647 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01647 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms