Protein–RNA interactions for Protein: P00520

Abl1, Tyrosine-protein kinase ABL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abl1P00520 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Abl1P00520 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Abl1P00520 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Abl1P00520 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Abl1P00520 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Abl1P00520 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Abl1P00520 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Abl1P00520 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Abl1P00520 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Abl1P00520 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Abl1P00520 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Abl1P00520 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Abl1P00520 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Abl1P00520 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Abl1P00520 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Abl1P00520 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Abl1P00520 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Abl1P00520 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Abl1P00520 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Abl1P00520 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abl1P00520 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abl1P00520 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abl1P00520 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abl1P00520 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abl1P00520 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abl1P00520 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abl1P00520 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abl1P00520 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Abl1P00520 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abl1P00520 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abl1P00520 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abl1P00520 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abl1P00520 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abl1P00520 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abl1P00520 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Abl1P00520 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Abl1P00520 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abl1P00520 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abl1P00520 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abl1P00520 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abl1P00520 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abl1P00520 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abl1P00520 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Abl1P00520 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Abl1P00520 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Abl1P00520 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Abl1P00520 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Abl1P00520 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Abl1P00520 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abl1P00520 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Abl1P00520 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abl1P00520 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abl1P00520 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Abl1P00520 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abl1P00520 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abl1P00520 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abl1P00520 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abl1P00520 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Abl1P00520 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abl1P00520 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abl1P00520 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abl1P00520 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abl1P00520 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abl1P00520 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Abl1P00520 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Abl1P00520 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abl1P00520 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abl1P00520 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abl1P00520 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abl1P00520 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Abl1P00520 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abl1P00520 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abl1P00520 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abl1P00520 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abl1P00520 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abl1P00520 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Abl1P00520 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abl1P00520 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abl1P00520 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abl1P00520 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Abl1P00520 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abl1P00520 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abl1P00520 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abl1P00520 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Abl1P00520 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Abl1P00520 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Abl1P00520 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Abl1P00520 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Abl1P00520 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Abl1P00520 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abl1P00520 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abl1P00520 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abl1P00520 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abl1P00520 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abl1P00520 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abl1P00520 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abl1P00520 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abl1P00520 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abl1P00520 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Abl1P00520 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1706.9 ms