Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sypl2O89104 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sypl2O89104 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sypl2O89104 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sypl2O89104 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sypl2O89104 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sypl2O89104 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sypl2O89104 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sypl2O89104 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sypl2O89104 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sypl2O89104 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sypl2O89104 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sypl2O89104 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sypl2O89104 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sypl2O89104 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sypl2O89104 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sypl2O89104 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sypl2O89104 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sypl2O89104 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sypl2O89104 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sypl2O89104 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sypl2O89104 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sypl2O89104 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sypl2O89104 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sypl2O89104 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sypl2O89104 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sypl2O89104 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sypl2O89104 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sypl2O89104 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Sypl2O89104 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sypl2O89104 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sypl2O89104 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sypl2O89104 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sypl2O89104 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sypl2O89104 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sypl2O89104 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sypl2O89104 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sypl2O89104 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms