Protein–RNA interactions for Protein: O89051

Itm2b, Integral membrane protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2bO89051 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itm2bO89051 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itm2bO89051 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itm2bO89051 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itm2bO89051 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itm2bO89051 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itm2bO89051 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itm2bO89051 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itm2bO89051 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Itm2bO89051 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itm2bO89051 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Itm2bO89051 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itm2bO89051 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itm2bO89051 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itm2bO89051 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itm2bO89051 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itm2bO89051 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itm2bO89051 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itm2bO89051 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itm2bO89051 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itm2bO89051 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itm2bO89051 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itm2bO89051 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itm2bO89051 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itm2bO89051 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itm2bO89051 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itm2bO89051 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itm2bO89051 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itm2bO89051 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itm2bO89051 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itm2bO89051 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itm2bO89051 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itm2bO89051 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itm2bO89051 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itm2bO89051 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itm2bO89051 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Itm2bO89051 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itm2bO89051 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itm2bO89051 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itm2bO89051 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms