Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Setdb1O88974 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Setdb1O88974 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Setdb1O88974 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Setdb1O88974 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Setdb1O88974 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Setdb1O88974 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Setdb1O88974 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Setdb1O88974 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Setdb1O88974 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Setdb1O88974 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Setdb1O88974 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Setdb1O88974 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Setdb1O88974 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.3 ms