Protein–RNA interactions for Protein: O88851

Rbbp9, Putative hydrolase RBBP9, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp9O88851 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbbp9O88851 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rbbp9O88851 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rbbp9O88851 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms