Protein–RNA interactions for Protein: O88708

Orc4, Origin recognition complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Orc4O88708 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Orc4O88708 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Orc4O88708 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Orc4O88708 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Orc4O88708 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Orc4O88708 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Orc4O88708 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Orc4O88708 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Orc4O88708 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Orc4O88708 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Orc4O88708 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Orc4O88708 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Orc4O88708 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Orc4O88708 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Orc4O88708 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Orc4O88708 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Orc4O88708 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Orc4O88708 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Orc4O88708 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Orc4O88708 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Orc4O88708 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Orc4O88708 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Orc4O88708 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Orc4O88708 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Orc4O88708 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Orc4O88708 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Orc4O88708 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Orc4O88708 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Orc4O88708 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Orc4O88708 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Orc4O88708 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Orc4O88708 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Orc4O88708 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Orc4O88708 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Orc4O88708 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Orc4O88708 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Orc4O88708 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Orc4O88708 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Orc4O88708 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Orc4O88708 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms