Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
BlmO88700 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
BlmO88700 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
BlmO88700 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
BlmO88700 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
BlmO88700 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
BlmO88700 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
BlmO88700 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
BlmO88700 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC33■■■□□ 2.87
BlmO88700 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
BlmO88700 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
BlmO88700 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
BlmO88700 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
BlmO88700 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
BlmO88700 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
BlmO88700 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
BlmO88700 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
BlmO88700 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
BlmO88700 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
BlmO88700 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
BlmO88700 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
BlmO88700 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
BlmO88700 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
BlmO88700 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
BlmO88700 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
BlmO88700 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
BlmO88700 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
BlmO88700 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
BlmO88700 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
BlmO88700 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
BlmO88700 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
BlmO88700 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
BlmO88700 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
BlmO88700 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
BlmO88700 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
BlmO88700 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
BlmO88700 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
BlmO88700 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
BlmO88700 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
BlmO88700 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
BlmO88700 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
BlmO88700 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
BlmO88700 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
BlmO88700 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
BlmO88700 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
BlmO88700 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
BlmO88700 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
BlmO88700 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
BlmO88700 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
BlmO88700 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
BlmO88700 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
BlmO88700 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
BlmO88700 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
BlmO88700 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
BlmO88700 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
BlmO88700 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
BlmO88700 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
BlmO88700 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
BlmO88700 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
BlmO88700 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
BlmO88700 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
BlmO88700 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
BlmO88700 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
BlmO88700 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
BlmO88700 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
BlmO88700 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
BlmO88700 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
BlmO88700 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
BlmO88700 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
BlmO88700 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
BlmO88700 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
BlmO88700 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
BlmO88700 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
BlmO88700 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
BlmO88700 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
BlmO88700 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
BlmO88700 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
BlmO88700 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
BlmO88700 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
BlmO88700 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
BlmO88700 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
BlmO88700 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
BlmO88700 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
BlmO88700 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
BlmO88700 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
BlmO88700 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
BlmO88700 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
BlmO88700 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
BlmO88700 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
BlmO88700 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
BlmO88700 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
BlmO88700 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
BlmO88700 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
BlmO88700 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
BlmO88700 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
BlmO88700 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
BlmO88700 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
BlmO88700 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
BlmO88700 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
BlmO88700 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms