Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Dnmt3bO88509 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnmt3bO88509 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnmt3bO88509 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms