Protein–RNA interactions for Protein: O55106

Strn, Striatin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StrnO55106 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
StrnO55106 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
StrnO55106 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
StrnO55106 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
StrnO55106 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
StrnO55106 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
StrnO55106 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
StrnO55106 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
StrnO55106 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
StrnO55106 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
StrnO55106 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
StrnO55106 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
StrnO55106 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
StrnO55106 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
StrnO55106 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
StrnO55106 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
StrnO55106 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
StrnO55106 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
StrnO55106 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
StrnO55106 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
StrnO55106 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
StrnO55106 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
StrnO55106 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
StrnO55106 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
StrnO55106 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
StrnO55106 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
StrnO55106 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
StrnO55106 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
StrnO55106 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
StrnO55106 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
StrnO55106 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
StrnO55106 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
StrnO55106 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
StrnO55106 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
StrnO55106 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
StrnO55106 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
StrnO55106 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
StrnO55106 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
StrnO55106 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
StrnO55106 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
StrnO55106 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
StrnO55106 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
StrnO55106 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
StrnO55106 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
StrnO55106 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
StrnO55106 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
StrnO55106 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
StrnO55106 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
StrnO55106 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
StrnO55106 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
StrnO55106 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
StrnO55106 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
StrnO55106 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
StrnO55106 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
StrnO55106 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
StrnO55106 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
StrnO55106 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
StrnO55106 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
StrnO55106 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
StrnO55106 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
StrnO55106 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
StrnO55106 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
StrnO55106 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
StrnO55106 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
StrnO55106 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
StrnO55106 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
StrnO55106 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
StrnO55106 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
StrnO55106 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
StrnO55106 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
StrnO55106 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
StrnO55106 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
StrnO55106 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
StrnO55106 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
StrnO55106 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
StrnO55106 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
StrnO55106 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
StrnO55106 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
StrnO55106 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
StrnO55106 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
StrnO55106 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
StrnO55106 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
StrnO55106 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
StrnO55106 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
StrnO55106 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
StrnO55106 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
StrnO55106 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
StrnO55106 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
StrnO55106 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
StrnO55106 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
StrnO55106 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
StrnO55106 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
StrnO55106 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
StrnO55106 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
StrnO55106 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
StrnO55106 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
StrnO55106 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
StrnO55106 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
StrnO55106 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
StrnO55106 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms