Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Copb2O55029 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Copb2O55029 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Copb2O55029 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Copb2O55029 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Copb2O55029 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Copb2O55029 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Copb2O55029 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Copb2O55029 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Copb2O55029 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Copb2O55029 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Copb2O55029 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Copb2O55029 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Copb2O55029 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Copb2O55029 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Copb2O55029 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Copb2O55029 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Copb2O55029 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Copb2O55029 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Copb2O55029 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Copb2O55029 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Copb2O55029 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Copb2O55029 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Copb2O55029 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Copb2O55029 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Copb2O55029 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Copb2O55029 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Copb2O55029 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Copb2O55029 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Copb2O55029 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Copb2O55029 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Copb2O55029 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Copb2O55029 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Copb2O55029 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Copb2O55029 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Copb2O55029 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Copb2O55029 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Copb2O55029 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Copb2O55029 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Copb2O55029 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Copb2O55029 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Copb2O55029 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Copb2O55029 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Copb2O55029 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Copb2O55029 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Copb2O55029 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Copb2O55029 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Copb2O55029 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Copb2O55029 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Copb2O55029 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Copb2O55029 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Copb2O55029 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Copb2O55029 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Copb2O55029 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Copb2O55029 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Copb2O55029 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Copb2O55029 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Copb2O55029 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Copb2O55029 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Copb2O55029 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Copb2O55029 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Copb2O55029 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Copb2O55029 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Copb2O55029 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Copb2O55029 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Copb2O55029 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Copb2O55029 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Copb2O55029 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.4 ms