Protein–RNA interactions for Protein: O54891

Lgals6, Galectin-6, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals6O54891 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgals6O54891 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgals6O54891 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgals6O54891 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgals6O54891 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgals6O54891 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgals6O54891 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgals6O54891 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgals6O54891 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgals6O54891 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgals6O54891 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgals6O54891 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lgals6O54891 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lgals6O54891 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms