Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChkaO54804 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChkaO54804 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChkaO54804 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChkaO54804 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChkaO54804 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ChkaO54804 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ChkaO54804 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ChkaO54804 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ChkaO54804 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ChkaO54804 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChkaO54804 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChkaO54804 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ChkaO54804 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChkaO54804 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ChkaO54804 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChkaO54804 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChkaO54804 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChkaO54804 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ChkaO54804 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChkaO54804 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChkaO54804 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ChkaO54804 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChkaO54804 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChkaO54804 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ChkaO54804 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChkaO54804 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChkaO54804 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChkaO54804 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ChkaO54804 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChkaO54804 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChkaO54804 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChkaO54804 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ChkaO54804 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChkaO54804 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChkaO54804 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ChkaO54804 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ChkaO54804 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChkaO54804 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ChkaO54804 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChkaO54804 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ChkaO54804 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ChkaO54804 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ChkaO54804 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChkaO54804 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
ChkaO54804 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChkaO54804 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChkaO54804 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChkaO54804 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ChkaO54804 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChkaO54804 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ChkaO54804 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ChkaO54804 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ChkaO54804 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ChkaO54804 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ChkaO54804 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ChkaO54804 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ChkaO54804 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ChkaO54804 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ChkaO54804 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ChkaO54804 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ChkaO54804 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
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