Protein–RNA interactions for Protein: O35984

Pbx2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx2O35984 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pbx2O35984 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pbx2O35984 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pbx2O35984 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pbx2O35984 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pbx2O35984 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pbx2O35984 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pbx2O35984 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pbx2O35984 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pbx2O35984 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pbx2O35984 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pbx2O35984 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pbx2O35984 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pbx2O35984 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pbx2O35984 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pbx2O35984 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pbx2O35984 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pbx2O35984 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pbx2O35984 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pbx2O35984 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pbx2O35984 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pbx2O35984 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pbx2O35984 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pbx2O35984 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pbx2O35984 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pbx2O35984 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pbx2O35984 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pbx2O35984 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pbx2O35984 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pbx2O35984 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pbx2O35984 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pbx2O35984 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pbx2O35984 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pbx2O35984 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pbx2O35984 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pbx2O35984 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pbx2O35984 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pbx2O35984 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pbx2O35984 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pbx2O35984 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pbx2O35984 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pbx2O35984 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pbx2O35984 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pbx2O35984 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pbx2O35984 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pbx2O35984 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pbx2O35984 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pbx2O35984 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pbx2O35984 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pbx2O35984 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pbx2O35984 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pbx2O35984 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pbx2O35984 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pbx2O35984 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pbx2O35984 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pbx2O35984 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.4 ms