Protein–RNA interactions for Protein: O35949

Elovl3, Elongation of very long chain fatty acids protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elovl3O35949 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Elovl3O35949 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Elovl3O35949 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Elovl3O35949 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Elovl3O35949 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Elovl3O35949 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Elovl3O35949 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Elovl3O35949 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Elovl3O35949 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Elovl3O35949 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Elovl3O35949 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Elovl3O35949 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Elovl3O35949 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Elovl3O35949 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Elovl3O35949 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Elovl3O35949 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Elovl3O35949 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Elovl3O35949 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Elovl3O35949 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Elovl3O35949 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Elovl3O35949 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Elovl3O35949 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Elovl3O35949 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Elovl3O35949 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Elovl3O35949 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Elovl3O35949 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Elovl3O35949 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Elovl3O35949 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Elovl3O35949 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Elovl3O35949 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Elovl3O35949 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Elovl3O35949 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Elovl3O35949 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Elovl3O35949 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Elovl3O35949 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Elovl3O35949 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Elovl3O35949 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Elovl3O35949 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Elovl3O35949 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Elovl3O35949 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Elovl3O35949 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Elovl3O35949 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Elovl3O35949 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Elovl3O35949 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Elovl3O35949 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Elovl3O35949 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Elovl3O35949 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Elovl3O35949 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Elovl3O35949 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Elovl3O35949 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Elovl3O35949 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Elovl3O35949 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms