Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnxbO35452 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnxbO35452 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnxbO35452 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TnxbO35452 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TnxbO35452 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TnxbO35452 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TnxbO35452 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TnxbO35452 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
TnxbO35452 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TnxbO35452 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TnxbO35452 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TnxbO35452 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnxbO35452 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnxbO35452 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnxbO35452 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnxbO35452 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TnxbO35452 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnxbO35452 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnxbO35452 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnxbO35452 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnxbO35452 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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TnxbO35452 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TnxbO35452 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TnxbO35452 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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TnxbO35452 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TnxbO35452 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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TnxbO35452 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TnxbO35452 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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TnxbO35452 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TnxbO35452 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TnxbO35452 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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TnxbO35452 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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TnxbO35452 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TnxbO35452 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TnxbO35452 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TnxbO35452 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TnxbO35452 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TnxbO35452 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TnxbO35452 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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TnxbO35452 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TnxbO35452 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TnxbO35452 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TnxbO35452 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TnxbO35452 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TnxbO35452 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TnxbO35452 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TnxbO35452 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TnxbO35452 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TnxbO35452 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TnxbO35452 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TnxbO35452 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TnxbO35452 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TnxbO35452 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnxbO35452 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnxbO35452 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnxbO35452 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 185.1 ms