Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-ObO35424 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms