Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nedd9O35177 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nedd9O35177 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms