Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scarb2O35114 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Scarb2O35114 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Scarb2O35114 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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