Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IfnabL7MTU6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms