Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vwa3bJ9JI28 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vwa3bJ9JI28 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vwa3bJ9JI28 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vwa3bJ9JI28 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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