Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smim18J3QNP2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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