Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3336J3QMQ6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3336J3QMQ6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm3336J3QMQ6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3336J3QMQ6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3336J3QMQ6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3336J3QMQ6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3336J3QMQ6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3336J3QMQ6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3336J3QMQ6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3336J3QMQ6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3336J3QMQ6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3336J3QMQ6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3336J3QMQ6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm3336J3QMQ6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3336J3QMQ6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3336J3QMQ6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3336J3QMQ6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm3336J3QMQ6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3336J3QMQ6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3336J3QMQ6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3336J3QMQ6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3336J3QMQ6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3336J3QMQ6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3336J3QMQ6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3336J3QMQ6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm3336J3QMQ6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3336J3QMQ6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3336J3QMQ6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3336J3QMQ6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3336J3QMQ6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3336J3QMQ6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3336J3QMQ6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3336J3QMQ6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3336J3QMQ6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3336J3QMQ6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm3336J3QMQ6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm3336J3QMQ6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm3336J3QMQ6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3336J3QMQ6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3336J3QMQ6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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