Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pabpc4lG5E8X2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pabpc4lG5E8X2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Pabpc4lG5E8X2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pabpc4lG5E8X2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pabpc4lG5E8X2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pabpc4lG5E8X2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pabpc4lG5E8X2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pabpc4lG5E8X2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pabpc4lG5E8X2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pabpc4lG5E8X2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pabpc4lG5E8X2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pabpc4lG5E8X2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pabpc4lG5E8X2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pabpc4lG5E8X2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pabpc4lG5E8X2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pabpc4lG5E8X2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pabpc4lG5E8X2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pabpc4lG5E8X2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pabpc4lG5E8X2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pabpc4lG5E8X2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pabpc4lG5E8X2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pabpc4lG5E8X2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pabpc4lG5E8X2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pabpc4lG5E8X2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pabpc4lG5E8X2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pabpc4lG5E8X2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pabpc4lG5E8X2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms