Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn20G5E8X0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn20G5E8X0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.1 ms