Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp17lcG5E8I7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp17lcG5E8I7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp17lcG5E8I7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp17lcG5E8I7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp17lcG5E8I7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp17lcG5E8I7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp17lcG5E8I7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp17lcG5E8I7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp17lcG5E8I7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp17lcG5E8I7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp17lcG5E8I7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp17lcG5E8I7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp17lcG5E8I7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Usp17lcG5E8I7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp17lcG5E8I7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp17lcG5E8I7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
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