Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NpcdF8VQB8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NpcdF8VQB8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NpcdF8VQB8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NpcdF8VQB8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NpcdF8VQB8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NpcdF8VQB8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NpcdF8VQB8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NpcdF8VQB8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NpcdF8VQB8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NpcdF8VQB8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NpcdF8VQB8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NpcdF8VQB8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NpcdF8VQB8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NpcdF8VQB8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NpcdF8VQB8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NpcdF8VQB8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NpcdF8VQB8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NpcdF8VQB8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NpcdF8VQB8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NpcdF8VQB8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NpcdF8VQB8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NpcdF8VQB8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NpcdF8VQB8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NpcdF8VQB8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NpcdF8VQB8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NpcdF8VQB8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NpcdF8VQB8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NpcdF8VQB8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NpcdF8VQB8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NpcdF8VQB8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NpcdF8VQB8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NpcdF8VQB8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NpcdF8VQB8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NpcdF8VQB8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NpcdF8VQB8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NpcdF8VQB8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NpcdF8VQB8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NpcdF8VQB8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NpcdF8VQB8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NpcdF8VQB8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NpcdF8VQB8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NpcdF8VQB8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NpcdF8VQB8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NpcdF8VQB8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NpcdF8VQB8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NpcdF8VQB8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NpcdF8VQB8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NpcdF8VQB8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NpcdF8VQB8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NpcdF8VQB8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NpcdF8VQB8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NpcdF8VQB8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NpcdF8VQB8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NpcdF8VQB8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NpcdF8VQB8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NpcdF8VQB8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NpcdF8VQB8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NpcdF8VQB8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NpcdF8VQB8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NpcdF8VQB8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NpcdF8VQB8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NpcdF8VQB8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NpcdF8VQB8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NpcdF8VQB8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NpcdF8VQB8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NpcdF8VQB8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NpcdF8VQB8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NpcdF8VQB8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NpcdF8VQB8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NpcdF8VQB8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NpcdF8VQB8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NpcdF8VQB8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NpcdF8VQB8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NpcdF8VQB8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NpcdF8VQB8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NpcdF8VQB8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NpcdF8VQB8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NpcdF8VQB8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NpcdF8VQB8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NpcdF8VQB8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NpcdF8VQB8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NpcdF8VQB8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NpcdF8VQB8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NpcdF8VQB8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NpcdF8VQB8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NpcdF8VQB8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NpcdF8VQB8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NpcdF8VQB8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NpcdF8VQB8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NpcdF8VQB8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NpcdF8VQB8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NpcdF8VQB8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NpcdF8VQB8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NpcdF8VQB8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NpcdF8VQB8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NpcdF8VQB8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NpcdF8VQB8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NpcdF8VQB8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NpcdF8VQB8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms