Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
5830473C10RikF8VQ07 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
5830473C10RikF8VQ07 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
5830473C10RikF8VQ07 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
5830473C10RikF8VQ07 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
5830473C10RikF8VQ07 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
5830473C10RikF8VQ07 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
5830473C10RikF8VQ07 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
5830473C10RikF8VQ07 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
5830473C10RikF8VQ07 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
5830473C10RikF8VQ07 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
5830473C10RikF8VQ07 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
5830473C10RikF8VQ07 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
5830473C10RikF8VQ07 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
5830473C10RikF8VQ07 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
5830473C10RikF8VQ07 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
5830473C10RikF8VQ07 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
5830473C10RikF8VQ07 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
5830473C10RikF8VQ07 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
5830473C10RikF8VQ07 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
5830473C10RikF8VQ07 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
5830473C10RikF8VQ07 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms