Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm3443F7CCV5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3443F7CCV5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3443F7CCV5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3443F7CCV5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3443F7CCV5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3443F7CCV5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3443F7CCV5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3443F7CCV5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3443F7CCV5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3443F7CCV5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3443F7CCV5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3443F7CCV5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3443F7CCV5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3443F7CCV5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3443F7CCV5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3443F7CCV5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3443F7CCV5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3443F7CCV5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3443F7CCV5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3443F7CCV5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3443F7CCV5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3443F7CCV5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3443F7CCV5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3443F7CCV5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3443F7CCV5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3443F7CCV5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3443F7CCV5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3443F7CCV5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3443F7CCV5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3443F7CCV5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3443F7CCV5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3443F7CCV5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3443F7CCV5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3443F7CCV5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3443F7CCV5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3443F7CCV5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3443F7CCV5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3443F7CCV5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms