Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm8247F6VRJ8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm8247F6VRJ8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm8247F6VRJ8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms