Protein–RNA interactions for Protein: F6S0S7

E130114P18Rik, RIKEN cDNA E130114P18 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130114P18RikF6S0S7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E130114P18RikF6S0S7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
E130114P18RikF6S0S7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.2 ms