Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc146E9Q9F7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc146E9Q9F7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc146E9Q9F7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc146E9Q9F7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc146E9Q9F7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc146E9Q9F7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc146E9Q9F7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc146E9Q9F7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc146E9Q9F7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc146E9Q9F7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc146E9Q9F7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc146E9Q9F7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc146E9Q9F7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc146E9Q9F7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc146E9Q9F7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc146E9Q9F7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc146E9Q9F7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc146E9Q9F7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc146E9Q9F7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc146E9Q9F7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc146E9Q9F7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc146E9Q9F7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc146E9Q9F7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc146E9Q9F7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc146E9Q9F7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc146E9Q9F7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc146E9Q9F7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc146E9Q9F7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc146E9Q9F7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc146E9Q9F7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc146E9Q9F7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc146E9Q9F7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc146E9Q9F7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc146E9Q9F7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc146E9Q9F7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc146E9Q9F7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc146E9Q9F7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc146E9Q9F7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc146E9Q9F7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc146E9Q9F7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Ccdc146E9Q9F7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc146E9Q9F7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc146E9Q9F7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc146E9Q9F7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc146E9Q9F7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc146E9Q9F7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc146E9Q9F7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc146E9Q9F7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc146E9Q9F7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc146E9Q9F7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc146E9Q9F7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc146E9Q9F7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc146E9Q9F7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc146E9Q9F7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms