Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3M9

2010300C02Rik, RIKEN cDNA 2010300C02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2010300C02RikE9Q3M9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
2010300C02RikE9Q3M9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
2010300C02RikE9Q3M9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
2010300C02RikE9Q3M9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
2010300C02RikE9Q3M9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
2010300C02RikE9Q3M9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
2010300C02RikE9Q3M9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
2010300C02RikE9Q3M9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
2010300C02RikE9Q3M9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
2010300C02RikE9Q3M9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
2010300C02RikE9Q3M9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
2010300C02RikE9Q3M9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
2010300C02RikE9Q3M9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
2010300C02RikE9Q3M9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
2010300C02RikE9Q3M9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
2010300C02RikE9Q3M9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
2010300C02RikE9Q3M9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
2010300C02RikE9Q3M9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
2010300C02RikE9Q3M9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
2010300C02RikE9Q3M9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
2010300C02RikE9Q3M9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
2010300C02RikE9Q3M9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
2010300C02RikE9Q3M9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
2010300C02RikE9Q3M9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
2010300C02RikE9Q3M9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.7 ms