Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrp3E9Q1T6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Lrp3E9Q1T6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lrp3E9Q1T6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms