Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
2610021A01RikE9Q0Q3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms