Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ryr1E9PZQ0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ryr1E9PZQ0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms