Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Trappc8E9PWG2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Trappc8E9PWG2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Trappc8E9PWG2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Trappc8E9PWG2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Trappc8E9PWG2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Trappc8E9PWG2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Trappc8E9PWG2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Trappc8E9PWG2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Trappc8E9PWG2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
Trappc8E9PWG2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Trappc8E9PWG2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Trappc8E9PWG2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Trappc8E9PWG2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Trappc8E9PWG2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Trappc8E9PWG2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Trappc8E9PWG2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Trappc8E9PWG2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Trappc8E9PWG2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Trappc8E9PWG2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Trappc8E9PWG2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Trappc8E9PWG2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Trappc8E9PWG2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
Trappc8E9PWG2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Trappc8E9PWG2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
Trappc8E9PWG2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Trappc8E9PWG2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Trappc8E9PWG2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Trappc8E9PWG2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Trappc8E9PWG2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Trappc8E9PWG2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Trappc8E9PWG2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Trappc8E9PWG2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Trappc8E9PWG2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Trappc8E9PWG2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Trappc8E9PWG2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Trappc8E9PWG2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Trappc8E9PWG2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Trappc8E9PWG2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Trappc8E9PWG2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Trappc8E9PWG2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Trappc8E9PWG2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Trappc8E9PWG2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Trappc8E9PWG2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Trappc8E9PWG2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Trappc8E9PWG2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Trappc8E9PWG2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Trappc8E9PWG2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Trappc8E9PWG2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Trappc8E9PWG2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Trappc8E9PWG2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Trappc8E9PWG2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Trappc8E9PWG2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Trappc8E9PWG2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Trappc8E9PWG2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Trappc8E9PWG2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Trappc8E9PWG2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Trappc8E9PWG2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Trappc8E9PWG2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Trappc8E9PWG2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Trappc8E9PWG2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Trappc8E9PWG2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Trappc8E9PWG2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Trappc8E9PWG2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Trappc8E9PWG2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Trappc8E9PWG2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Trappc8E9PWG2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Trappc8E9PWG2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Trappc8E9PWG2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Trappc8E9PWG2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Trappc8E9PWG2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Trappc8E9PWG2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Trappc8E9PWG2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Trappc8E9PWG2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Trappc8E9PWG2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Trappc8E9PWG2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Trappc8E9PWG2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Trappc8E9PWG2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Trappc8E9PWG2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Trappc8E9PWG2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Trappc8E9PWG2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Trappc8E9PWG2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Trappc8E9PWG2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.65
Trappc8E9PWG2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Trappc8E9PWG2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Trappc8E9PWG2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Trappc8E9PWG2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Trappc8E9PWG2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Trappc8E9PWG2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Trappc8E9PWG2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Trappc8E9PWG2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Trappc8E9PWG2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Trappc8E9PWG2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Trappc8E9PWG2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Trappc8E9PWG2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Trappc8E9PWG2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Trappc8E9PWG2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Trappc8E9PWG2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Trappc8E9PWG2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Trappc8E9PWG2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms