Protein–RNA interactions for Protein: E9PUQ3

AU019823, Expressed sequence AU019823, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU019823E9PUQ3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AU019823E9PUQ3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AU019823E9PUQ3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AU019823E9PUQ3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AU019823E9PUQ3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AU019823E9PUQ3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
AU019823E9PUQ3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AU019823E9PUQ3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms