Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R4

Nkx6-2, NK6 homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-2D3Z4R4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkx6-2D3Z4R4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkx6-2D3Z4R4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkx6-2D3Z4R4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkx6-2D3Z4R4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkx6-2D3Z4R4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkx6-2D3Z4R4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkx6-2D3Z4R4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkx6-2D3Z4R4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkx6-2D3Z4R4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkx6-2D3Z4R4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkx6-2D3Z4R4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkx6-2D3Z4R4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkx6-2D3Z4R4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkx6-2D3Z4R4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkx6-2D3Z4R4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nkx6-2D3Z4R4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nkx6-2D3Z4R4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nkx6-2D3Z4R4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nkx6-2D3Z4R4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nkx6-2D3Z4R4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx6-2D3Z4R4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nkx6-2D3Z4R4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nkx6-2D3Z4R4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms