Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc8D3YZV8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc8D3YZV8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc8D3YZV8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms