Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
1700015F17RikD3YUK8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
1700015F17RikD3YUK8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
1700015F17RikD3YUK8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms