Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Phf11bB4XVQ1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Phf11bB4XVQ1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Phf11bB4XVQ1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Phf11bB4XVQ1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Phf11bB4XVQ1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Phf11bB4XVQ1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Phf11bB4XVQ1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Phf11bB4XVQ1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Phf11bB4XVQ1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Phf11bB4XVQ1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Phf11bB4XVQ1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Phf11bB4XVQ1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Phf11bB4XVQ1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Phf11bB4XVQ1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Phf11bB4XVQ1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Phf11bB4XVQ1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Phf11bB4XVQ1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Phf11bB4XVQ1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Phf11bB4XVQ1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Phf11bB4XVQ1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Phf11bB4XVQ1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phf11bB4XVQ1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phf11bB4XVQ1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phf11bB4XVQ1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phf11bB4XVQ1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phf11bB4XVQ1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phf11bB4XVQ1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phf11bB4XVQ1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phf11bB4XVQ1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Phf11bB4XVQ1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Phf11bB4XVQ1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Phf11bB4XVQ1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phf11bB4XVQ1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phf11bB4XVQ1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phf11bB4XVQ1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phf11bB4XVQ1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phf11bB4XVQ1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phf11bB4XVQ1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Phf11bB4XVQ1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf11bB4XVQ1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf11bB4XVQ1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf11bB4XVQ1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf11bB4XVQ1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phf11bB4XVQ1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf11bB4XVQ1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf11bB4XVQ1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf11bB4XVQ1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phf11bB4XVQ1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf11bB4XVQ1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf11bB4XVQ1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phf11bB4XVQ1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf11bB4XVQ1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf11bB4XVQ1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf11bB4XVQ1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Phf11bB4XVQ1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf11bB4XVQ1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf11bB4XVQ1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf11bB4XVQ1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf11bB4XVQ1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf11bB4XVQ1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf11bB4XVQ1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phf11bB4XVQ1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf11bB4XVQ1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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